石見銀山は江戸時代前期にも日本の膨大な銀需要を支えた（銅も産出）が、元禄期になると次第に産出量が少なくなり、江戸末期には深く掘らなければ銀を産出できなくなり地下水にも悩まされ採算がとれなくなっていった。
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1866年（慶応2年）6月の第二次長州戦争において、幕府は石見国に紀州藩・備後福山藩・浜田藩・松江藩の藩兵を出動させたが、長州軍の進発を食い止めることができず、7月に浜田藩主・松平武聡は浜田城を脱出しその後落城した。これにより長州軍の石見銀山領への進撃は不可避なものとなり、最後の大森代官・鍋田三郎右衛門成憲は7月20日の夜に銀山付の役人を引き連れて備中国倉敷へと逃亡し、石見銀山の幕府支配は終焉を迎えた[15]。
以後、旧石見銀山領は長州藩によって支配されることとなり、鍋田成憲が逃亡したのちに発生した一揆は長州藩などによって鎮められた。そして、1869年（明治2年）8月に大森県が設置されたことによって長州藩による支配は終わった[16]。
明治期以降の石見銀山と終末 [編集]
石見銀山は1867年（明治元年）の太政官布告による民間払い下げにより田中義太郎が経営権を取得したものの、1872年（明治5年）の浜田地震の被害を受けてしばらく休山となった[17]（1873年（明治6年）頃に松江市の安達惣右衛門が別の鉱区を経営していたともいわれるが記録が少なく詳細についてはわかっていない[18]。）。その後、1887年（明治19年）からは大阪の藤田組（後に同和鉱業から現在はDOWAホールディングス）により再開発の試みが続けられた。藤田組は採鉱施設・事務所などを大森から柑子谷（仁摩町大国）の「永久鉱山」に移したが、鉱山から主に採掘されていた銅の価格の暴落や坑内の環境の悪化などにより1923年（大正12年）には休山するに至った[19]。その後、日中戦争、太平洋戦争の最中、軍需物資としての銅の国産化を目論んで、1941年（昭和16年）より銅の再産出を試みるものの、1943年（昭和18年）の水害で坑道が水没する大打撃を受け、完全閉山となる。鉱業権はDOWAホールディングスが保有している。
現在でも銀山採掘のために掘られた「間歩」と呼ばれる坑道が500余り残り、大久保間歩及び龍源寺間歩の一部が一般公開されている（大久保間歩の公開はツアー形式での限定公開）。